RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 FOXN1O15353 648 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 CHGBP05060 677 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 TM4SF4P48230 202 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 OTOFQ9HC10 1997 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 GJA5P36382 358 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 PPATQ06203 517 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 MYH7P12883 1935 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 FOCADQ5VW36 1801 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 PCNTO95613 3336 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 FAM196BA6NMK8 535 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SLURP2P0DP57 97 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 GTF2A2P52657 109 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 PPIL2Q13356 520 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-215ENST00000514625 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.52■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 PRKAB2O43741 272 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TICAM2Q86XR7 235 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 OSBP2Q969R2 916 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 RILPL2Q969X0 211 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 EHD4Q9H223 541 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 RNF186Q9NXI6 227 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TRPA1O75762 1119 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 SNAPC2Q13487 334 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 IRF6O14896 467 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 ALDH1A1P00352 501 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 GNAT2P19087 354 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 M0R2C6 588 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 GPAA1O43292 621 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 CETPP11597 493 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 PTPRAP18433 802 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 CAP2P40123 477 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 CCL15Q16663 113 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 IFNL1Q8IU54 200 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.48■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 MYH1P12882 1939 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 PDE4AP27815 886 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 PLCD1P51178 756 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 LBX1P52954 281 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC18Q9H819 358 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TSKSQ9UJT2 592 aa21.47■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 APPP05067 770 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 GINM1Q9NU53 330 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.46■■□□□ 1.03
FAAP20-215ENST00000514625 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CXCL11O14625 94 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ASNSP08243 561 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.45■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L5A8MUK1 530 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L12C9JPN9 530 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L21D6R901 530 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SWAP70Q9UH65 585 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.44■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SIPA1L1O43166 1804 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 GDF11O95390 407 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CYP2D6P10635 497 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 TDO2P48775 406 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 C12orf60Q5U649 245 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 PTPN18Q99952 460 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 DOCK1Q14185 1865 aa21.43■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 HIP1O00291 1037 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms