RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 CHRNDQ07001 517 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 CCL15Q16663 113 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 TDHQ8IZJ6 230 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 LPIN2Q92539 896 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 SLC5A1P13866 664 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 SDSP20132 328 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 FGFR2P21802 821 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 GRK4P32298 578 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 TIMM10P62072 90 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.09■□□□□ 0.17
FOXD1-201ENST00000513595 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UBE4AQ14139 1066 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 GORABQ5T7V8 394 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CASC1Q6TDU7 716 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SPOCK2Q92563 424 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 XAGE2Q96GT9 111 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 OCEL1Q9H607 264 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SRRDQ9UH36 339 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SPEF2Q9C093 1822 aa16.08■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 HOXD10P28358 340 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 RAET1EQ8TD07 263 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 MYO1BO43795 1136 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CAPN2P17655 700 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TICAM2Q86XR7 235 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 EVI5LQ96CN4 794 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM47Q96LD4 638 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TNFRSF10AO00220 468 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SGPL1O95470 568 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UBXN2AP68543 259 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 GTF2IP78347 998 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 RASA3Q14644 834 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 RILPL2Q969X0 211 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 HAUS7Q99871 368 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CLRN2A0PK11 232 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TAF5LO75529 589 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SYN1P17600 705 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CTGFP29279 349 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 ADORA1P30542 326 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 PSMC4P43686 418 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 C17orf99Q6UX52 265 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 A0A1B0GUL6 1792 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 HIP1O00291 1037 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CETPP11597 493 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 OSBPP22059 807 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 KCNJ4P48050 445 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 VEZTQ9HBM0 779 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 BTBD19C9JJ37 291 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 MAP3K9P80192 1104 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 VGLL4Q14135 290 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 CFAP100Q494V2 611 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXD1-201ENST00000513595 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 MAP3K12Q12852 859 aa16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC102BQ68D86 513 aa16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 CERS5Q8N5B7 392 aa16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 MYPNQ86TC9 1320 aa16■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 SPDYE5A6NIY4 337 aa16■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FOXD1-201ENST00000513595 CHMLP26374 656 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms