RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 BCRP11274 1271 aa27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 AACSQ86V21 672 aa27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 COG6Q9Y2V7 657 aa27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.69■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 FLT1P17948 1338 aa27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.68■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM75PA6NK02 468 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 CAP2P40123 477 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM47Q96LD4 638 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa27.67■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 PRMT2P55345 433 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.66■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 CENPFP49454 3210 aa27.65■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 PSMC4P43686 418 aa27.65■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 DNAJC18Q9H819 358 aa27.65■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 MGAMO43451 1857 aa27.64■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 CYP7A1P22680 504 aa27.64■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 SRRDQ9UH36 339 aa27.64■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.64■■■□□ 2.02
ZBED3-203ENST00000511587 OSBPP22059 807 aa27.63■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 NBPF11Q86T75 865 aa27.63■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.63■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 PALD1Q9ULE6 856 aa27.62■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 HMMRO75330 724 aa27.61■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 SPP2Q13103 211 aa27.61■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 TREML2Q5T2D2 321 aa27.61■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.61■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L5A8MUK1 530 aa27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 JAG1P78504 1218 aa27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 CERS3Q8IU89 383 aa27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.6■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 MYH1P12882 1939 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 HOXD10P28358 340 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 MAP3K12Q12852 859 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM106CQ9BVX2 250 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 MYPNQ86TC9 1320 aa27.59■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 FCGRTP55899 365 aa27.58■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.58■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ZBED3-203ENST00000511587 APBB1O00213 710 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 ASNSP08243 561 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 HMGCS2P54868 508 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 WDR18Q9BV38 432 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 BRCA2P51587 3418 aa27.57■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 RAB11FIP3O75154 756 aa27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 PRKCZQ05513 592 aa27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 PDE3AQ14432 1141 aa27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 PNMA3Q9UL41 463 aa27.56■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 HLA-DOAP06340 250 aa27.55■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 GINM1Q9NU53 330 aa27.55■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 RAET1EQ8TD07 263 aa27.54■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 GDF11O95390 407 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 GRK4P32298 578 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 USP5P45974 858 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 MTMR2Q13614 643 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.53■■■□□ 2
ZBED3-203ENST00000511587 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms