RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 TERF1P54274 439 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 A0A1W2PNR3 127 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 UQCRHP07919 91 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 WDR44Q5JSH3 913 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 HGSNATQ68CP4 663 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.66□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 RGS20O76081 388 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 RASGRP1O95267 797 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 BMP6P22004 513 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 GUCY2FP51841 1108 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 IL17RAQ96F46 866 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 MBD5Q9P267 1494 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 BPNT1O95861 308 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 KCNQ4P56696 695 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 DMTNQ08495 405 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 TM9SF2Q99805 663 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 MAF1Q9H063 256 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.65□□□□□ -1.34
SEC24D-211ENST00000511481 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 A0A096LPE4 126 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 A0A1W2PPZ6 126 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 TIMP2P16035 220 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 GUCY2CP25092 1073 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MSX1P28360 303 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 POU4F2Q12837 409 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MEIOBQ8N635 442 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 KIF2CQ99661 725 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 CHST12Q9NRB3 414 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 A0A1B0GTH6 734 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SH3BP5O60239 455 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 TRPA1O75762 1119 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MYL1P05976 194 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SOX18P35713 384 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 RAB27AP51159 221 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SLFN5Q08AF3 891 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 CEP120Q8N960 986 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 ATL2Q8NHH9 583 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 KATNA1O75449 491 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 EYA4O95677 639 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 KCNC4Q03721 635 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 VPS72Q15906 364 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 PANK1Q8TE04 598 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 GSX2Q9BZM3 304 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 SAMM50Q9Y512 469 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 NFKBIEO00221 500 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 ATF3P18847 181 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 NEK2P51955 445 aa6.63□□□□□ -1.35
SEC24D-211ENST00000511481 CCINQ13939 588 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms