RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MAFGO15525 162 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 RFPL1O75677 317 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FGAP02671 866 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ACRP10323 421 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PLAURQ03405 335 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 STRN3Q13033 797 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FAM209AQ5JX71 171 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 DGKHQ86XP1 1220 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MUC3BQ9H195 1237 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 AGRPO00253 132 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 HTR3BO95264 441 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NPTXRO95502 500 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ARNTP27540 789 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 DHCR24Q15392 516 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 AHI1Q8N157 1196 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 RNF217Q8TC41 542 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PPM1EQ8WY54 764 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PNMA5Q96PV4 448 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CDC6Q99741 560 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CBX8Q9HC52 389 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 DACH1Q9UI36 760 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.25□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PQU0 124 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TNFRSF10CO14798 259 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 BRINP1O60477 761 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ABLIM3O94929 683 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 B3GALT4O96024 378 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NFKB1P19838 968 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 POU5F1BQ06416 359 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MORC3Q14149 939 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 STAT4Q14765 748 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GMIPQ9P107 970 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 INTUQ9ULD6 942 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.24□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 EFSO43281 561 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NRDCO43847 1150 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MAP3K6O95382 1288 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 F2P00734 622 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 FAM157BP0CG42 384 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SELPP16109 830 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SLC7A5Q01650 507 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PCDH1Q08174 1060 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 E2F7Q96AV8 911 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ATG4CQ96DT6 458 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms