RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 PLIN5Q00G26 463 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 MTMR3Q13615 1198 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PTPN14Q15678 1187 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 IL31Q6EBC2 164 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PJA1Q8NG27 643 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 SEPT3Q9UH03 358 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 IPPQ9Y573 584 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 USP31Q70CQ4 1352 aa8.51□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 NEK3P51956 506 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 KRT83P78385 493 aa8.51□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 LAMC2Q13753 1193 aa8.51□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 EML3Q32P44 896 aa8.51□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 FBF1Q8TES7 1133 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 RNF19AQ9NV58 838 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM51Q9NW97 253 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 C19orf81C9J6K1 198 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 ARIH2O95376 493 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 NAT2P11245 290 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 GYS1P13807 737 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 UBA7P41226 1012 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DGKGP49619 791 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ARID5BQ14865 1188 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 FLCNQ8NFG4 579 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 BHMTQ93088 406 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 FAM25EA8MYX2 175 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 RAC2P15153 192 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ETFBP38117 255 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 RENBPP51606 427 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 SLC20A2Q08357 652 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 SQSTM1Q13501 440 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf27AQ580R0 203 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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PDCD4-211ENST00000498367 MFSD3Q96ES6 412 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ZFATQ9P243 1243 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 A6NCN8 305 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ERICH4A6NGS2 130 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 NBNO60934 754 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ROR1Q01973 937 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 APOBRQ0VD83 1088 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ERFEQ4G0M1 354 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 OBP2AQ9NY56 170 aa8.48□□□□□ -1.05
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