RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 HLA-DOAP06340 250 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 LBX1P52954 281 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 INHBEP58166 350 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPATQ06203 517 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRKAB2O43741 272 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPIL2Q13356 520 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 APPBP2Q92624 585 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 FSD1Q9BTV5 496 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2Q1-207ENST00000497453 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 IRF6O14896 467 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTF2A2P52657 109 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSBP2Q969R2 916 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC18Q9H819 358 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRAP18433 802 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTC6Q86TZ1 520 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFNL1Q8IU54 200 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 EVI5LQ96CN4 794 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PICK1Q9NRD5 415 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYH7P12883 1935 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPN18Q99952 460 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 SIPA1L1O43166 1804 aa21.49■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNAPC2Q13487 334 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCL15Q16663 113 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 EHD4Q9H223 541 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 LAMB1P07942 1786 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 M0R2C6 588 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CETPP11597 493 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDE4AP27815 886 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAP2P40123 477 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLCD1P51178 756 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 TBC1D8O95759 1140 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALDH1A1P00352 501 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 EVX2Q03828 476 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYH1P12882 1939 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPAA1O43292 621 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYP2D6P10635 497 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 DOCK1Q14185 1865 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 CXCL11O14625 94 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GDF11O95390 407 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 JAG1P78504 1218 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 RILPL2Q969X0 211 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GABPAQ06546 454 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L5A8MUK1 530 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 BTBD19C9JJ37 291 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L12C9JPN9 530 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L21D6R901 530 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASNSP08243 561 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GNAT2P19087 354 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHMT1P34896 483 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 MOGSQ13724 837 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTR9Q6PD62 1173 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 TICAM2Q86XR7 235 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 GINM1Q9NU53 330 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms