RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	DISC1	Q9NRI5	854 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	FAM170B	A6NMN3	283 aa		5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	DBX1	A6NMT0	343 aa		5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	LGR6	Q9HBX8	967 aa		5	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM37	O94972	964 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PAPLN	O95428	1278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ADM	P35318	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	LRRC14	Q15048	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	SORBS3	O60504	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	NEFM	P07197	916 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	GATA6	Q92908	595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	LIG3	P49916	1009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ERVK-24	P63145	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	INPP5A	Q14642	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	WDR62	O43379	1518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ETV1-222	ENST00000493831		F6X3S4	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	NTF4	P34130	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	CDK8	P49336	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	RING1	Q06587	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ISL2	Q96A47	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	SEPT6	Q14141	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF124	Q15973	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	FAM168A	Q92567	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	KDM6B	O15054	1643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETV1-222	ENST00000493831	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms