RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	TLR2	O60603	784 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	HAUS7	Q99871	368 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	CAP2	P40123	477 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	GINM1	Q9NU53	330 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	GOLIM4	O00461	696 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE6A	P16499	860 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	RGS19	P49795	217 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	AAMP	Q13685	434 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SERBP1-208	ENST00000493607	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	HLA-DOA	P06340	250 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	PALD1	Q9ULE6	856 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM196B	A6NMK8	535 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	PDHX	O00330	501 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	EHD4	Q9H223	541 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.25	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	USP5	P45974	858 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	DNAJC18	Q9H819	358 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM17	Q9Y577	477 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ASNS	P08243	561 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	C17orf99	Q6UX52	265 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	EFCC1	Q9HA90	598 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L5	A8MUK1	530 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ADD2	P35612	726 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	TTC6	Q86TZ1	520 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	GNRH1	P01148	92 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	UBE3C	Q15386	1083 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	WDR18	Q9BV38	432 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SERBP1-208	ENST00000493607	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	CRBN	Q96SW2	442 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM75P	A6NK02	468 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF22	Q14807	665 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	CAP1	Q01518	475 aa		28.17	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	SPP2	Q13103	211 aa		28.17	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	BCL11A	Q9H165	835 aa		28.17	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	HTT	P42858	3142 aa		28.17	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	PRMT2	P55345	433 aa		28.16	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		28.16	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		28.16	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	MGAM	O43451	1857 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	BCR	P11274	1271 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	LCORL	Q8N3X6	602 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	GABPA	Q06546	454 aa		28.14	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.14	■■■□□ 2.1
SERBP1-208	ENST00000493607	GCC1	Q96CN9	775 aa		28.14	■■■□□ 2.1

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