RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 SPP2Q13103 211 aa23.74■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.74■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 FAM196BA6NMK8 535 aa23.73■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 PICALMQ13492 652 aa23.73■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 TTC28Q96AY4 2481 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 CYP2B6P20813 491 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 PHKA1P46020 1223 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 HMGCS2P54868 508 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 ATP2B3Q16720 1220 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 FAM161BQ96MY7 647 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 USP44Q9H0E7 712 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.72■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 SEMA3EO15041 775 aa23.71■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 TBC1D12O60347 775 aa23.71■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
C7orf49-211ENST00000487774 BTDP43251 543 aa23.7■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 LHX8Q68G74 356 aa23.7■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.7■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 PEX10O60683 326 aa23.69■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ZBTB22O15209 634 aa23.68■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 RHBDL3P58872 404 aa23.68■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.68■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 31.7
C7orf49-211ENST00000487774 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.67■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.67■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ADORA1P30542 326 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 USP6NLQ92738 828 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 SIL1Q9H173 461 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.66■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CIAO1O76071 339 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CAP2P40123 477 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 RASGRF1Q13972 1273 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CCDC102BQ68D86 513 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF384Q8TF68 577 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 ABCF2Q9UG63 623 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 CDH23Q9H251 3354 aa23.65■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.64■■□□□ 1.38
C7orf49-211ENST00000487774 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 USP17L5A8MUK1 530 aa23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 CCL14Q16627 93 aa23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 SLF2Q8IX21 1173 aa23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.63■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 FBXO3Q9UK99 471 aa23.63■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.62■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 PTPRCP08575 1304 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 HERVK_113P62684 666 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MECOMQ03112 1051 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MTMR2Q13614 643 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MORN1Q5T089 497 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 WDR18Q9BV38 432 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 PORCNQ9H237 461 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 LTBP2Q14767 1821 aa23.61■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MAPK4P31152 587 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 PDE3AQ14432 1141 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 Q3C1V9 767 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 MUC3AQ02505 3323 aa23.6■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 RGS2P41220 211 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 BACE1P56817 501 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 JAG1P78504 1218 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 GPR142Q7Z601 462 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 SIPA1L1O43166 1804 aa23.59■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 APBA2Q99767 749 aa23.58■■□□□ 1.37
C7orf49-211ENST00000487774 TIMM10P62072 90 aa23.57■■□□□ 1.36
C7orf49-211ENST00000487774 ERVK-9P63128 1117 aa23.57■■□□□ 1.36
C7orf49-211ENST00000487774 ERVK-24P63145 666 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms