RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 USP17L12C9JPN9 530 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 USP17L21D6R901 530 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 ZFPM1Q8IX07 1006 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 SWAP70Q9UH65 585 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 UNCXA6NJT0 531 aa27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 TRAF5O00463 557 aa27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 C12orf60Q5U649 245 aa27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.17■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 LBX1P52954 281 aa27.16■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 VPS53Q5VIR6 699 aa27.16■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 CTR9Q6PD62 1173 aa27.16■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 LAMB1P07942 1786 aa27.16■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 MINDY4BA8MYZ0 360 aa27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 FGAP02671 866 aa27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 RASSF10A6NK89 507 aa27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 PCP11498 1178 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 NT5C2P49902 561 aa27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K10Q02779 954 aa27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 PDE4BQ07343 736 aa27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF213O14771 459 aa27.13■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 PPARAQ07869 468 aa27.13■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K11Q16584 847 aa27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 RNF20Q5VTR2 975 aa27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 MAP4K1Q92918 833 aa27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 ABHD8Q96I13 439 aa27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 MYH8P13535 1937 aa27.12■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.11■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 IL25Q9H293 177 aa27.11■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 GINM1Q9NU53 330 aa27.11■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.11■■□□□ 1.93
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NBPF3-212ENST00000486229 PLCD1P51178 756 aa27.1■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.1■■□□□ 1.93
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NBPF3-212ENST00000486229 LAMA4Q16363 1823 aa27.09■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.09■■□□□ 1.93
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NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K9P80192 1104 aa27.08■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 PTH1RQ03431 593 aa27.08■■□□□ 1.93
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NBPF3-212ENST00000486229 CDAN1Q8IWY9 1227 aa27.08■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 WRNIP1Q96S55 665 aa27.08■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.08■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.08■■□□□ 1.93
NBPF3-212ENST00000486229 SIPA1L1O43166 1804 aa27.07■■□□□ 1.92
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NBPF3-212ENST00000486229 CST9Q5W186 159 aa27.07■■□□□ 1.92
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NBPF3-212ENST00000486229 DLK2Q6UY11 383 aa27.06■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.06■■□□□ 1.92
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NBPF3-212ENST00000486229 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 CDK8P49336 464 aa27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 RGS19P49795 217 aa27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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NBPF3-212ENST00000486229 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 PICK1Q9NRD5 415 aa27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 ASNSP08243 561 aa27.04■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 HUNKP57058 714 aa27.04■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 TRDNQ13061 729 aa27.04■■□□□ 1.92
NBPF3-212ENST00000486229 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.04■■□□□ 1.92
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