RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 KCNQ4P56696 695 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP10Q86W26 655 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MICU3Q86XE3 530 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYND10O75800 440 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY2CP25092 1073 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K9P80192 1104 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PRR29P0C7W0 189 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC175P0C221 793 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 BRD3Q15059 726 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM5Q71RC9 77 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 STX17P56962 302 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 TRDNQ13061 729 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CLIC6Q96NY7 704 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PNKPQ96T60 521 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CENPHQ9H3R5 247 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 B4E1Z4 1266 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC5O00471 708 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CASP8Q14790 479 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PHKBQ93100 1093 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 GPR108Q9NPR9 543 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PALLDQ8WX93 1383 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 COL18A1P39060 1754 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CIAO1O76071 339 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE8P0CG41 777 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SENP2Q9HC62 589 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 FOXP2O15409 715 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CCT5P48643 541 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTSWP56202 376 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 APPBP2Q92624 585 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0U1RQJ8 604 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPHQ15003 741 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 VSTM4Q8IW00 320 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 BANK1Q8NDB2 785 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 VSNL1P62760 191 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA7Q8NI08 942 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 JCADQ9P266 1359 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 AIDAQ96BJ3 306 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC102BQ68D86 513 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 FAM212AQ96EL1 285 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE9A4FU28 777 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ERLIN2O94905 339 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ANO1Q5XXA6 986 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CEP112Q8N8E3 955 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RNF40O75150 1001 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms