RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TERF2	Q15554	542 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RREB1	Q92766	1687 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BIN1	O00499	593 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPTLC2	O15270	562 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRMP	Q12912	555 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FEZ1	Q99689	392 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHD4	Q14839	1912 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALX1	Q15699	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM66	O15016	1216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IQCB1	Q15051	598 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPARA	Q07869	468 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RFC4	P35249	363 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BTAF1	O14981	1849 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF75D	P51815	510 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WTAP	Q15007	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AFF2	P51816	1311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PFKFB1	P16118	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STX1A	Q16623	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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