RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MYH1P12882 1939 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MGAMO43451 1857 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CENPFP49454 3210 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PLCG2P16885 1265 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 USP5P45974 858 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 RAET1EQ8TD07 263 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 GCC1Q96CN9 775 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 GPR108Q9NPR9 543 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PALD1Q9ULE6 856 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRFP10586 1907 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL11O14625 94 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 HMMRO75330 724 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SPP2Q13103 211 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MYPNQ86TC9 1320 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GDF11O95390 407 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 HLA-DOAP06340 250 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD10P28358 340 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 HMGCS2P54868 508 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K12Q12852 859 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf99Q6UX52 265 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CEP290O15078 2479 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L5A8MUK1 530 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GOLIM4O00461 696 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CAP2P40123 477 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FCGRTP55899 365 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TREML2Q5T2D2 321 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM47Q96LD4 638 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FOCADQ5VW36 1801 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FLT1P17948 1338 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D12O60347 775 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPP22059 807 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CTGFP29279 349 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PRKCZQ05513 592 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR2Q13614 643 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MOGSQ13724 837 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ARMC5Q96C12 935 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FEZ1Q99689 392 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SRRDQ9UH36 339 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GNRH1P01148 92 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GRK4P32298 578 aa9.8□□□□□ -0.84
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