RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CCDC192P0DO97 292 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 WTAPQ15007 396 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SENP2Q9HC62 589 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SLX4Q8IY92 1834 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 USP5P45974 858 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NID2Q14112 1375 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ORC4O43929 436 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 OFD1O75665 1012 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CDKL5O76039 1030 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PLCG2P16885 1265 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CHRNA5P30532 468 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NT5C2P49902 561 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 GAKO14976 1311 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 BTDP43251 543 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 G3V3G9 751 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 SMIM22K7EJ46 135 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RCAN1P53805 252 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K11Q16584 847 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 TERF1P54274 439 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 MICU3Q86XE3 530 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PDE4BQ07343 736 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 SEC23AQ15436 765 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 DOK7Q18PE1 504 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 C12orf60Q5U649 245 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CCDC125Q86Z20 511 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 TNKSO95271 1327 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PODNQ7Z5L7 613 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 IQCA1Q86XH1 822 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 USP17L8P0C7I0 530 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CYP2D6P10635 497 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 LIG1P18858 919 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CDC27P30260 824 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 FBXW7Q969H0 707 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 PRDM1O75626 825 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 RXRAP19793 462 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-204ENST00000476231 NTRK3Q16288 839 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TEX11Q8IYF3 940 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 MYL10Q9BUA6 226 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 PPFIA3O75145 1194 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CAVIN2O95810 425 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 RHBDL3P58872 404 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 EVX2Q03828 476 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 PPP2R5BQ15173 497 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CERS5Q8N5B7 392 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 PGBD1Q96JS3 809 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 C8orf76Q96K31 380 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TNMDQ9H2S6 317 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 DACT1Q9NYF0 836 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ADCY5O95622 1261 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.12■■□□□ 1.13
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