RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 PALD1Q9ULE6 856 aa23.55■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.55■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 RAD50Q92878 1312 aa23.55■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 APPP05067 770 aa23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.54■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 ALX1Q15699 326 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 SBK1Q52WX2 424 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 CASC1Q6TDU7 716 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 EHD4Q9H223 541 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 FOCADQ5VW36 1801 aa23.53■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.52■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AUP1-207ENST00000472800 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 USP17L12C9JPN9 530 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 USP17L21D6R901 530 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CA12O43570 354 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CDC45O75419 566 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.51■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 TDO2P48775 406 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 PRKG1Q13976 671 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 C12orf60Q5U649 245 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CTR9Q6PD62 1173 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.5■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 SGSM2O43147 1006 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 PLCD1P51178 756 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 HUNKP57058 714 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 MAP3K9P80192 1104 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 NAPBQ9H115 298 aa23.49■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 VPS53Q5VIR6 699 aa23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 ZMYM6O95789 1325 aa23.48■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 FOXP2O15409 715 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 MOB2Q70IA6 237 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 SWAP70Q9UH65 585 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 MYH1P12882 1939 aa23.47■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 FGAP02671 866 aa23.46■■□□□ 1.35
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AUP1-207ENST00000472800 NOGQ13253 232 aa23.46■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 WRNIP1Q96S55 665 aa23.46■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CSADQ9Y600 493 aa23.46■■□□□ 1.35
AUP1-207ENST00000472800 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 GINM1Q9NU53 330 aa23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 FZD1Q9UP38 647 aa23.45■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 CYP2D6P10635 497 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.44■■□□□ 1.34
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AUP1-207ENST00000472800 CCDC102AQ96A19 550 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ZIC5Q96T25 663 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 IL25Q9H293 177 aa23.44■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.44■■□□□ 1.34
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AUP1-207ENST00000472800 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.43■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.43■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 DNAJC18Q9H819 358 aa23.43■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.43■■□□□ 1.34
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AUP1-207ENST00000472800 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.42■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 CAP2P40123 477 aa23.42■■□□□ 1.34
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AUP1-207ENST00000472800 CDK8P49336 464 aa23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 VGLL4Q14135 290 aa23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 CCDC17Q96LX7 622 aa23.41■■□□□ 1.34
AUP1-207ENST00000472800 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.4■■□□□ 1.34
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