RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	RLF	Q13129	1914 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	DNM1L	O00429	736 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	IGFBP4	P22692	258 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	PBX2	P40425	430 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	GCKR	Q14397	625 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	GPR37L1	O60883	481 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	USP6NL	Q92738	828 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	FOXO4	P98177	505 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SNX17	Q15036	470 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	LPAR1	Q92633	364 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MAST3	O60307	1309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CNGA1	P29973	690 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	RGS2	P41220	211 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	HMGCS2	P54868	508 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	APBA2	Q99767	749 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	NHLH1	Q02575	133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SPP2	Q13103	211 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MORN1	Q5T089	497 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PORCN	Q9H237	461 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TLE2	Q04725	743 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	G2E3	Q7L622	706 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	FPGS	Q05932	587 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MSC	O60682	206 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MAPK4	P31152	587 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	RGS3	P49796	1198 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693		Q3C1V9	767 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	UTY	O14607	1347 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-204	ENST00000468693	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CLTB	P09497	229 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	RAG1	P15918	1043 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CYP2C19	P33261	490 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms