RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 SLFN14P0C7P3 912 aa4.29□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 ISL2Q96A47 359 aa4.29□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 VWCEQ96DN2 955 aa4.29□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.29□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 H3BS24 57 aa4.28□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.28□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.28□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.28□□□□□ -1.72
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SHQ1-204ENST00000468347 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.26□□□□□ -1.73
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SHQ1-204ENST00000468347 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.23□□□□□ -1.73
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SHQ1-204ENST00000468347 USP17L12C9JPN9 530 aa4.22□□□□□ -1.73
SHQ1-204ENST00000468347 USP17L11C9JVI0 530 aa4.22□□□□□ -1.73
SHQ1-204ENST00000468347 USP17L21D6R901 530 aa4.22□□□□□ -1.73
SHQ1-204ENST00000468347 USP17L18D6R9N7 530 aa4.22□□□□□ -1.73
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SHQ1-204ENST00000468347 ARXQ96QS3 562 aa4.21□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.21□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 OR14I1A6ND48 311 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 FAM196BA6NMK8 535 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 HRKO00198 91 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 GRIA4P48058 902 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 INHBEP58166 350 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 NR0B2Q15466 257 aa4.2□□□□□ -1.74
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