RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	KLRG1	Q96E93	195 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PCNT	O95613	3336 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GAK	O14976	1311 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TRAF5	O00463	557 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	S1PR4	O95977	384 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SLC10A3	P09131	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PRDX5	P30044	214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	MCAM	P43121	646 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CST9	Q5W186	159 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CFH	P08603	1231 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	NF2	P35240	595 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SLC19A1	P41440	591 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GRIK5	Q16478	980 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	FAM83A	Q86UY5	434 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	AACS	Q86V21	672 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	JMY	Q8N9B5	988 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CDCA5	Q96FF9	252 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TNNI2	P48788	182 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GSTO1	P78417	241 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CERS3	Q8IU89	383 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.22	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ECE1	P42892	770 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.21	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CLRN2	A0PK11	232 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	LDHC	P07864	332 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MYH7	P12883	1935 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MECOM	Q03112	1051 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.2	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	AOX1	Q06278	1338 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ATP5J	P18859	108 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	HTRA3	P83110	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	RASA3	Q14644	834 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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