RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465125.1

RERE-208, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 5

Gene RERE, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-208ENST00000465125 PRKG1Q13976 671 aa29.13■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.13■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.12■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 EVX2Q03828 476 aa29.12■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.12■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.255e-10■■■■□ 19.8
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RERE-208ENST00000465125 TBC1D12O60347 775 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 PPARAQ07869 468 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 MAP4K1Q92918 833 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 LAMA4Q16363 1823 aa29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 SLURP2P0DP57 97 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 FKBP1BP68106 108 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 MAP3K10Q02779 954 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 C8orf34Q49A92 452 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 CST9Q5W186 159 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 DNAJC18Q9H819 358 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 FZD1Q9UP38 647 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 SMIM22K7EJ46 135 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 HAND2P61296 217 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 GABPAQ06546 454 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 SWAP70Q9UH65 585 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-208ENST00000465125 ZNF213O14771 459 aa29.07■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.07■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.06■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 MOB2Q70IA6 237 aa29.06■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.06■■■□□ 2.24
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RERE-208ENST00000465125 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 MAP3K11Q16584 847 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 KLRG1Q96E93 195 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 SHMT1P34896 483 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 CDK8P49336 464 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 APLP1P51693 650 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 PDE4BQ07343 736 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 OTOFQ9HC10 1997 aa29.04■■■□□ 2.24
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RERE-208ENST00000465125 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.03■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.03■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 MAP3K9P80192 1104 aa29.02■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.02■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 NBPF3Q9H094 633 aa29.02■■■□□ 2.24
RERE-208ENST00000465125 CYP21A2P08686 494 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 INPP5BP32019 993 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 CSADQ9Y600 493 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 HUNKP57058 714 aa29■■■□□ 2.23
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RERE-208ENST00000465125 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 RNF20Q5VTR2 975 aa29■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 STAG1Q8WVM7 1258 aa29■■■□□ 2.23
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RERE-208ENST00000465125 SLC27A2O14975 620 aa28.99■■■□□ 2.23
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RERE-208ENST00000465125 PRDM1O75626 825 aa28.99■■■□□ 2.23
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RERE-208ENST00000465125 C1QTNF8P60827 252 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 CREBZFQ9NS37 354 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 TOMM22Q9NS69 142 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 DOCK1Q14185 1865 aa28.99■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 VGLL4Q14135 290 aa28.98■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RERE-208ENST00000465125 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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