RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 LCORLQ8N3X6 602 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 APPBP2Q92624 585 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 EVI5LQ96CN4 794 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 EHD4Q9H223 541 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 GINM1Q9NU53 330 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 RNF186Q9NXI6 227 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PALD1Q9ULE6 856 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CXCL11O14625 94 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CHGBP05060 677 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 OSBP2Q969R2 916 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 ARMT1Q9H993 441 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SIPA1L1O43166 1804 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 IRF6O14896 467 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 MBD4O95243 580 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 ALDH1A1P00352 501 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 HLA-DOAP06340 250 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SLURP2P0DP57 97 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CAP2P40123 477 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 GTF2A2P52657 109 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PTPRAP18433 802 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 GABPAQ06546 454 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 IFNL1Q8IU54 200 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 OTUD5Q96G74 571 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC18Q9H819 358 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PICK1Q9NRD5 415 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PRKAB2O43741 272 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 TRPA1O75762 1119 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 GNAT2P19087 354 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PLCD1P51178 756 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SNAPC2Q13487 334 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PTPN18Q99952 460 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 FSD1Q9BTV5 496 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 FAM196BA6NMK8 535 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 GPAA1O43292 621 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CETPP11597 493 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 PDE4AP27815 886 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 LBX1P52954 281 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 SBK1Q52WX2 424 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 C12orf60Q5U649 245 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 DOCK1Q14185 1865 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 ASNSP08243 561 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CCL15Q16663 113 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 WDR18Q9BV38 432 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 PCNTO95613 3336 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 USP17L5A8MUK1 530 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 USP17L12C9JPN9 530 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 USP17L21D6R901 530 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 M0R2C6 588 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 MOGSQ13724 837 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 SWAP70Q9UH65 585 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 PTPRFP10586 1907 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 SHMT1P34896 483 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 JAG1P78504 1218 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-206ENST00000462743 CTR9Q6PD62 1173 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms