RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462265.5

OPN3-202, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 5

Gene OPN3, Length 795 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-202ENST00000462265 SIN3BO75182 1162 aa8.2□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 WEE1P30291 646 aa8.2□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.2□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 LGR6Q9HBX8 967 aa8.2□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 MMP10P09238 476 aa8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SLC39A6Q13433 755 aa8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.19□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 RNMTO43148 476 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ADH7P40394 386 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 DGKGP49619 791 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 IDH3AP50213 366 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 IER5Q5VY09 327 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 STK32AQ8WU08 396 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 MRC1P22897 1456 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.18□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 GRIN3BO60391 1043 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 RFC4P35249 363 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.17□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 RPS6KA4O75676 772 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 IGHA1P01876 353 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 GYS1P13807 737 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ARSDP51689 593 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ATP10DQ9P241 1426 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 A0A0G2JLW4 131 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 M0R082 166 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 MSTNO14793 375 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ATG7O95352 703 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 NFKB1P19838 968 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 CCINQ13939 588 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 TNFRSF25Q93038 417 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 IFT43Q96FT9 208 aa8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
OPN3-202ENST00000462265 BCORQ6W2J9 1755 aa8.15□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 MICAL2O94851 1124 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 BCS1LQ9Y276 419 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 SCN7AQ01118 1682 aa8.14□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 DPEP1P16444 411 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 PRKAR2BP31323 418 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 C1QTNF8P60827 252 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 DDR1Q08345 913 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 MYO19Q96H55 970 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 PLVAPQ9BX97 442 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 NUP98P52948 1817 aa8.13□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 COL15A1P39059 1388 aa8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 COL8A1P27658 744 aa8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 TEFQ10587 303 aa8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 C16orf46Q6P387 395 aa8.12□□□□□ -1.11
OPN3-202ENST00000462265 TREML1Q86YW5 311 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms