RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 TRIM75PA6NK02 468 aa17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 CYP2C8P10632 490 aa17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 HOXD10P28358 340 aa17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 PPP4CP60510 307 aa17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.1■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 BCRP11274 1271 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 TRIM47Q96LD4 638 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 SRRDQ9UH36 339 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 SIPA1L1O43166 1804 aa17.08■□□□□ 0.33
ZBED1-204ENST00000461691 EN2P19622 333 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CTGFP29279 349 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CAP2P40123 477 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 ADGRA1Q86SQ6 560 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 AACSQ86V21 672 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.08■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 FLT1P17948 1338 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 IDH1O75874 414 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 OSBPP22059 807 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CYP7A1P22680 504 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MYH1P12882 1939 aa17.07■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MYPNQ86TC9 1320 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 USP17L5A8MUK1 530 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 FCGRTP55899 365 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SPP2Q13103 211 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 RAET1EQ8TD07 263 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 HMMRO75330 724 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CERS3Q8IU89 383 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 RHPN1Q8TCX5 695 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TRIM34Q9BYJ4 488 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 PNMA3Q9UL41 463 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 COG6Q9Y2V7 657 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 GRK4P32298 578 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MAP3K12Q12852 859 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TREML2Q5T2D2 321 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MAGEB6Q8N7X4 407 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 RCAN3Q9UKA8 241 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 PALD1Q9ULE6 856 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 HLA-DOAP06340 250 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 ASNSP08243 561 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 HMGCS2P54868 508 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 PRKCZQ05513 592 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 MIGA1Q8NAN2 632 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 ANTXR1Q9H6X2 564 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.03■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 CENPFP49454 3210 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 APBB1O00213 710 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SLC34A2O95436 690 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 USP5P45974 858 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 WDR18Q9BV38 432 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 DNAJC18Q9H819 358 aa17.02■□□□□ 0.32
ZBED1-204ENST00000461691 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 MTFR1Q15390 333 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 GINM1Q9NU53 330 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 GABRQQ9UN88 632 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 RAB11FIP3O75154 756 aa17■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 UBXN2AP68543 259 aa17■□□□□ 0.31
ZBED1-204ENST00000461691 FAM110CQ1W6H9 321 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms