RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS2O95450 1211 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 MYL5Q02045 173 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 DOCK2Q92608 1830 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 DEXIO95424 95 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 OLFM4Q6UX06 510 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 FANCBQ8NB91 859 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.55■■□□□ 1.36
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IMP4-208ENST00000460766 GYG1P46976 350 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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IMP4-208ENST00000460766 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.54■■□□□ 1.36
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IMP4-208ENST00000460766 NR5A1Q13285 461 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 FOXN1O15353 648 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ATP2B1P20020 1258 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 UBASH3AP57075 661 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 GRIN1Q05586 938 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 TNKSO95271 1327 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ESR2Q92731 530 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 MTA3Q9BTC8 594 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 KCND1Q9NSA2 647 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 SMIM22K7EJ46 135 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 NRDCO43847 1150 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 CFAP100Q494V2 611 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 SYCP1Q15431 976 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 OXER1Q8TDS5 423 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 DPF2Q92785 391 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PTPREP23469 700 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 KIF18AQ8NI77 898 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 FANCLQ9NW38 375 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CHD4Q14839 1912 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CBFA2T2O43439 604 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 RCAN1P53805 252 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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IMP4-208ENST00000460766 CABP5Q9NP86 173 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ZMYND15Q9H091 742 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 BMP6P22004 513 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 POSTNQ15063 836 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CBX1P83916 185 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PDE4BQ07343 736 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 SEC23AQ15436 765 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PDILTQ8N807 584 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 COL4A1P02462 1669 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PHLPP1O60346 1717 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 BCORQ6W2J9 1755 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PRDM1O75626 825 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PRR29P0C7W0 189 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PTPN21Q16825 1174 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 KCNQ2O43526 872 aa23.46■■□□□ 1.35
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