RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	SPP2	Q13103	211 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PFAS	O15067	1338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	COL6A1	P12109	1028 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CYP2B6	P20813	491 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAPK4	P31152	587 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PICALM	Q13492	652 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIB2	Q92519	343 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PTPRC	P08575	1304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CIAO1	O76071	339 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	HMGCS2	P54868	508 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIM32	Q13049	653 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CAP2	P40123	477 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	RGS2	P41220	211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	BTD	P43251	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GSTO1	P78417	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MSC	O60682	206 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	LDHC	P07864	332 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ASNS	P08243	561 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	PHKA1	P46020	1223 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	BACE1	P56817	501 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	LHX8	Q68G74	356 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP1-204	ENST00000460605	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	HERVK_113	P62684	666 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCNA1	P78396	465 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	APBA2	Q99767	749 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	MTMR2	Q13614	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	SIL1	Q9H173	461 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	RHBDL3	P58872	404 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	ERVK-24	P63145	666 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	MECOM	Q03112	1051 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	LPAR1	Q92633	364 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	USP6NL	Q92738	828 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP1-204	ENST00000460605	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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