RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.59□□□□□ -1.35
TTC3-211ENST00000460328 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.59□□□□□ -1.35
TTC3-211ENST00000460328 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 CD8BP10966 210 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ITIH2P19823 946 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 INPP5AQ14642 412 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 LCE1DQ5T752 114 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PRKCQQ04759 706 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 FZD5Q13467 585 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 AOC3Q16853 763 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 KCT2Q8NC54 265 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 VAV3Q9UKW4 847 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 AK5Q9Y6K8 562 aa6.57□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 CDK8P49336 464 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ITGB5P18084 799 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 FUT4P22083 530 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 FGD1P98174 961 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 HDXQ7Z353 690 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 FBRSQ9HAH7 460 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 LRIG2O94898 1065 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 EOMESO95936 686 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 SEPT6Q14141 434 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 MAP3K11Q16584 847 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 PARP2Q9UGN5 583 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 LMNB1P20700 586 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 LIG3P49916 1009 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 NKG7Q16617 165 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ASIC4Q96FT7 647 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.53□□□□□ -1.36
TTC3-211ENST00000460328 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 SLITRK5O94991 958 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PAPLNO95428 1278 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 MIPEPQ99797 713 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 FOXQ1Q9C009 403 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 GRK4P32298 578 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PSMD2Q13200 908 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 FAM161BQ96MY7 647 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 DAB2P98082 770 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 IKZF1Q13422 519 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 HID1Q8IV36 788 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PRR33A8MZF0 331 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 GFRA2O00451 464 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 BIN1O00499 593 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CAP2P40123 477 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CLCN7P51798 805 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 OGFOD2Q6N063 350 aa6.49□□□□□ -1.37
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