RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTFR1Q15390 333 aa10.42□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLF2Q8IX21 1173 aa10.42□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJC18Q9H819 358 aa10.42□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PRMT2P55345 433 aa10.41□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM3APO60318 1980 aa10.4□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKCZQ05513 592 aa10.4□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.4□□□□□ -0.74
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GAPDHP28-201ENST00000455134 FLT1P17948 1338 aa10.39□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CAP2P40123 477 aa10.39□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSTO1P78417 241 aa10.39□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.39□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SPP2Q13103 211 aa10.38□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.38□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.38□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANK1Q8TE04 598 aa10.38□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.38□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.37□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.37□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 FLT3LGP49771 235 aa10.36□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 FCGRTP55899 365 aa10.36□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAET1EQ8TD07 263 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PALD1Q9ULE6 856 aa10.36□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L5A8MUK1 530 aa10.35□□□□□ -0.75
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ELNP15502 786 aa10.35□□□□□ -0.75
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