RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-204ENST00000442563 OSBP2Q969R2 916 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 FSD1Q9BTV5 496 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXN1O15353 648 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2A2P52657 109 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 OTUD5Q96G74 571 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 CAP2P40123 477 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 GINM1Q9NU53 330 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 ALDH1A1P00352 501 aa20.26■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 GNAT2P19087 354 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 OTOFQ9HC10 1997 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 CXCL11O14625 94 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 PLCD1P51178 756 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 SNAPC2Q13487 334 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNL1Q8IU54 200 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC18Q9H819 358 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.24■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.24■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 PTPN18Q99952 460 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 USP17L12C9JPN9 530 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 USP17L21D6R901 530 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 ASNSP08243 561 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 LBX1P52954 281 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL15Q16663 113 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf60Q5U649 245 aa20.22■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.22■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 SBK1Q52WX2 424 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGEF1-204ENST00000442563 USP17L5A8MUK1 530 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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RABGEF1-204ENST00000442563 CTR9Q6PD62 1173 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 SIPA1L1O43166 1804 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 LAMB1P07942 1786 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2D6P10635 497 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 SDSP20132 328 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 SHMT1P34896 483 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1-204ENST00000442563 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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