RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 ARMC5Q96C12 935 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 RAB11FIP3O75154 756 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 HLA-DOAP06340 250 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 MOGSQ13724 837 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC78-204ENST00000439619 FAM196BA6NMK8 535 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 APBB1O00213 710 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 CAP2P40123 477 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PDE3AQ14432 1141 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 FLT1P17948 1338 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PSMC4P43686 418 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PNMA3Q9UL41 463 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 USP17L5A8MUK1 530 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SLURP2P0DP57 97 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 CYP2C8P10632 490 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 USP5P45974 858 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ASNSP08243 561 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 FCGRTP55899 365 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SPP2Q13103 211 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 BCL11AQ9H165 835 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 GINM1Q9NU53 330 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 CAP1Q01518 475 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF333Q96JL9 665 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 PALD1Q9ULE6 856 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 RAET1EQ8TD07 263 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SRRDQ9UH36 339 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 BCRP11274 1271 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM47Q96LD4 638 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC78-204ENST00000439619 DOCK1Q14185 1865 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 OSBPP22059 807 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 TTC6Q86TZ1 520 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 MYPNQ86TC9 1320 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 POTEFA5A3E0 1075 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 HMGCS2P54868 508 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 WDR18Q9BV38 432 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 GOLIM4O00461 696 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 C19orf81C9J6K1 198 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 TREML2Q5T2D2 321 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.246e-8■■■■■ 46.2
CCDC78-204ENST00000439619 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 PDE6AP16499 860 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 GRK4P32298 578 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 BACE1P56817 501 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 EHD4Q9H223 541 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 USP17L10C9JJH3 530 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 GDF11O95390 407 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 CTGFP29279 349 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 MTMR2Q13614 643 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC78-204ENST00000439619 COA7Q96BR5 231 aa22.77■■□□□ 1.24
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