RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 LDHCP07864 332 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 TFCP2Q12800 502 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 MEIS3Q99687 375 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTBP11-201ENST00000436287 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 HMGCRP04035 888 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 CAP2P40123 477 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 HMGCS2P54868 508 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 GSTO1P78417 241 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 MTX1Q13505 466 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 LRCH3Q96II8 777 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 GDF15Q99988 308 aa18.44■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 USP17L5A8MUK1 530 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 SRGAP3O43295 1099 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 BMP8BP34820 402 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATA5Q8NB90 893 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.43■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 PI16Q6UXB8 463 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 NBPF3Q9H094 633 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.42■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 GNAI3P08754 354 aa18.41■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 WDR18Q9BV38 432 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 RAI14Q9P0K7 980 aa18.41■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 GORABQ5T7V8 394 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX11Q8IYF3 940 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.4■□□□□ 0.54
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ACTBP11-201ENST00000436287 GPR153Q6NV75 609 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIB2Q92519 343 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.39■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.38■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 ASNSP08243 561 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP2B6P20813 491 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 JAG1P78504 1218 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 MTMR2Q13614 643 aa18.37■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 C19orf81C9J6K1 198 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 BAG3O95817 575 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.36■□□□□ 0.53
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ACTBP11-201ENST00000436287 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 PEX10O60683 326 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 PLCG2P16885 1265 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 SYN1P17600 705 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 HERVK_113P62684 666 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTBP11-201ENST00000436287 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
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