RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 FAM196BA6NMK8 535 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 HMMRO75330 724 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SLURP2P0DP57 97 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CAP2P40123 477 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 FCGRTP55899 365 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 AACSQ86V21 672 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 RAET1EQ8TD07 263 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SRRDQ9UH36 339 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 PNMA3Q9UL41 463 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 BCRP11274 1271 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CYP7A1P22680 504 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 TRIM47Q96LD4 638 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 HTTP42858 3142 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 USP17L5A8MUK1 530 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DOAP06340 250 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 OSBPP22059 807 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K12Q12852 859 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SPP2Q13103 211 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 DOCK1Q14185 1865 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MYPNQ86TC9 1320 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 ASNSP08243 561 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 FLT1P17948 1338 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 GRK4P32298 578 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 GINM1Q9NU53 330 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 PALD1Q9ULE6 856 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 COG6Q9Y2V7 657 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 CTGFP29279 349 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 USP5P45974 858 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 HMGCS2P54868 508 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 UBXN2AP68543 259 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 APBB1O00213 710 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 RAB11FIP3O75154 756 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 PRKCZQ05513 592 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 TREML2Q5T2D2 321 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 WDR18Q9BV38 432 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 C19orf81C9J6K1 198 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 TTC6Q86TZ1 520 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 COA7Q96BR5 231 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.42■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 SLC34A2O95436 690 aa18.41■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 BACE1P56817 501 aa18.41■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 GCC1Q96CN9 775 aa18.41■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 USP17L10C9JJH3 530 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 FLT3LGP49771 235 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 MTMR2Q13614 643 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC18Q9H819 358 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms