RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 GUCY1A2P33402 732 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 GSTO1P78417 241 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 IFNAR1P17181 557 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 FANCBQ8NB91 859 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 IQCA1Q86XH1 822 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NID2Q14112 1375 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NPR1P16066 1061 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 CLIC4Q9Y696 253 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 LAMB1P07942 1786 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 BAG3O95817 575 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ATL3Q6DD88 541 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ME1P48163 572 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 SBK1Q52WX2 424 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 BRAPQ7Z569 592 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 LTBP1Q14766 1721 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.95■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ORC4O43929 436 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 BTDP43251 543 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2IP78347 998 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TMC4Q7Z404 712 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW7Q969H0 707 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 STK36Q9NRP7 1315 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PDE6BP35913 854 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM29Q14134 588 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 POTEAQ6S8J7 498 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF11Q86T75 865 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 LDHCP07864 332 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PDE4BQ07343 736 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TNMDQ9H2S6 317 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PPP4CP60510 307 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf60Q5U649 245 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 MPNDQ8N594 471 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K11Q16584 847 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TSPY2A6NKD2 308 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 RCAN1P53805 252 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 STK38Q15208 465 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH1B1P30837 517 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 DOK7Q18PE1 504 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 MASTLQ96GX5 879 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TROAPQ12815 778 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 WASF1Q92558 559 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 F8W031 263 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 IGSF3O75054 1194 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 PLCD1P51178 756 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-209ENST00000428120 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.89■■□□□ 1.89
FAAP20-209ENST00000428120 TEX11Q8IYF3 940 aa26.89■■□□□ 1.89
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
FAAP20-209ENST00000428120 MXD3Q9BW11 206 aa26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms