RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 RING1Q06587 406 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 SEZ6Q53EL9 994 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 RNF214Q8ND24 703 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NKD1Q969G9 470 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NEFMP07197 916 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NFICP08651 508 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 DOC2BQ14184 412 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 REC114Q7Z4M0 266 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GPRASP2Q96D09 838 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 LRRC3Q9BY71 257 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 LGR6Q9HBX8 967 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GRK4P32298 578 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 MCM4P33991 863 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NTF4P34130 210 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ISL2Q96A47 359 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 FANCGO15287 622 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GJA8P48165 433 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NFKBIBQ15653 356 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GK5Q6ZS86 529 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 BEND4Q6ZU67 534 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 TINF2Q9BSI4 451 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 PGRP06401 933 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 PLCG1P19174 1290 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GINM1Q9NU53 330 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 HMX2A2RU54 273 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 CLCQ05315 142 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PDE4BQ07343 736 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FBRSQ9HAH7 460 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 STOML1Q9UBI4 398 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 RAXQ9Y2V3 346 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 HTR3BO95264 441 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ZNF165P49910 485 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 MAP7Q14244 749 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 NKG7Q16617 165 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PPT2Q9UMR5 302 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PAOXQ6QHF9 649 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 VPS37DQ86XT2 251 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 HID1Q8IV36 788 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 SPATA32Q96LK8 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 KCT2Q8NC54 265 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 KLHL3Q9UH77 587 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms