RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 AIDAQ96BJ3 306 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 UBASH3AP57075 661 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 NTRK3Q16288 839 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 LY9Q9HBG7 655 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE8BO95263 885 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL5Q02045 173 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP100Q494V2 611 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 LONRF3Q496Y0 759 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SPECC1Q5M775 1068 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 RESP18Q5W5W9 173 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM87BQ96K49 555 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.032e-15■■■□□ 14.9
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 HOMER1Q86YM7 354 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CNNM3Q8NE01 707 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 OLFM4Q6UX06 510 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXN1O15353 648 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCLQ9NW38 375 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CUTAO60888 179 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS22Q8NE09 1264 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPBQ9H115 298 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM232C9JQI7 657 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ6P48051 423 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CBFA2T2O43439 604 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZPR1O75312 459 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD4O95243 580 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.46■■□□□ 1.03
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SH3BP1-202ENST00000417536 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD18B2RXH4 712 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY1A2P33402 732 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMT1Q9H993 441 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM22Q9NS69 142 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 SBF2Q86WG5 1849 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE4BQ07343 736 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP10Q53GL7 1025 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAI1Q9UI46 699 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP6P22004 513 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAMP50895 628 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN1Q05586 938 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 VSTM4Q8IW00 320 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA5Q8NB90 893 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 RREB1Q92766 1687 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 LIFRP42702 1097 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 LPIN2Q92539 896 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.43■■□□□ 1.02
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