RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 FGRP09769 529 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNFAIP1Q13829 316 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRT32Q14532 448 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TTC6Q86TZ1 520 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 GGA3Q9NZ52 723 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 E7EWF7 191 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNNI2P48788 182 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 GABPAQ06546 454 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 RASA3Q14644 834 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 EHD4Q9H223 541 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 SIPA1L1O43166 1804 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 HLA-DOAP06340 250 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TEPSINQ96N21 525 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ORC4O43929 436 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 NEK1Q96PY6 1258 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 CSRNP1Q96S65 589 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 DNAJC18Q9H819 358 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 RRAGCQ9HB90 399 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 INCENPQ9NQS7 918 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 NEDD4P46934 1319 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 PSMA5P28066 241 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 CDK8P49336 464 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 NT5C2P49902 561 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAP3K10Q02779 954 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 PDE4BQ07343 736 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 RABEP1Q15276 862 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 NCOA7Q8NI08 942 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 SWAP70Q9UH65 585 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 TBC1D12O60347 775 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRDNQ13061 729 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRT23Q9C075 422 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 B4E1Z4 1266 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRDM1O75626 825 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 POTEIP0CG38 1075 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 POTEJP0CG39 1038 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLURP2P0DP57 97 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 CPA1P15085 419 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 RASA1P20936 1047 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 RPS6KB1P23443 525 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 SHMT1P34896 483 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 RUFY3Q7L099 469 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 SULF1Q8IWU6 871 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 IL27Q8NEV9 243 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.68□□□□□ -0.54
CD27-AS1-202ENST00000417058 KDM4AO75164 1064 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms