RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELP3Q9H9T3 547 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PICK1Q9NRD5 415 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF186Q9NXI6 227 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIPA1L1O43166 1804 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.34□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.34□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.34□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.34□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.34□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASNSP08243 561 aa10.33□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.33□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.33□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZIC5Q96T25 663 aa10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FZD1Q9UP38 647 aa10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.33□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.33□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APPBP2Q92624 585 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.32□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.31□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUCB1Q02818 461 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF6Q15052 776 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EVI5LQ96CN4 794 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL11AQ9H165 835 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SWAP70Q9UH65 585 aa10.31□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP17L5A8MUK1 530 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FSD1Q9BTV5 496 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR18Q9BV38 432 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PALD1Q9ULE6 856 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.3□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR25O00155 361 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKTNO75072 461 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNS4Q8IZW8 715 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCORLQ8N3X6 602 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERO1AQ96HE7 468 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.29□□□□□ -0.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.29□□□□□ -0.76
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