RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2HP62256 183 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.66□□□□□ -1.66
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LRRTM4-201ENST00000409088 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 OATP04181 439 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDX5P30044 214 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGDRQ13258 359 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC6Q86TZ1 520 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.66□□□□□ -1.66
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LRRTM4-201ENST00000409088 MARVELD3Q96A59 401 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SENP2Q9HC62 589 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TCHHQ07283 1943 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH7P12883 1935 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM22K7EJ46 135 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA3EO15041 775 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MECOMQ03112 1051 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 DDR1Q08345 913 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MICU3Q86XE3 530 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM87BQ96K49 555 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA32Q96LK8 384 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LEMD3Q9Y2U8 911 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SBF2Q86WG5 1849 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMB2P55268 1798 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 XDHP47989 1333 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LY75O60449 1722 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.65□□□□□ -1.66
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LRRTM4-201ENST00000409088 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PPARAQ07869 468 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RESTQ13127 1097 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL10Q9BUA6 226 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT23Q9C075 422 aa4.65□□□□□ -1.66
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMA4Q16363 1823 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYM6O95789 1325 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC69A6NI79 296 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 UFL1O94874 794 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT7P0C024 238 aa4.65□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPSM2P81274 684 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF827Q17R98 1081 aa4.65□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 ARAP2Q8WZ64 1704 aa4.65□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L21D6R901 530 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM1O75626 825 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC27P30260 824 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SART3Q15020 963 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF214Q8ND24 703 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PHKBQ93100 1093 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf76Q96K31 380 aa4.65□□□□□ -1.67
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