RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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HOXD12-201ENST00000404162 MRS2Q9HD23 443 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 ADORA1P30542 326 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 HMGCS2P54868 508 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.02■■□□□ 1.44
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HOXD12-201ENST00000404162 ABCF2Q9UG63 623 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD12-201ENST00000404162 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 PEX10O60683 326 aa24■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 CIAO1O76071 339 aa24■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 RHBDL3P58872 404 aa24■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRCP08575 1304 aa24■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 ATAD5Q96QE3 1844 aa24■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB22O15209 634 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 COL6A1P12109 1028 aa23.99■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 ZNF384Q8TF68 577 aa23.97■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 FAM161BQ96MY7 647 aa23.96■■□□□ 1.43
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HOXD12-201ENST00000404162 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD12-201ENST00000404162 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
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HOXD12-201ENST00000404162 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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HOXD12-201ENST00000404162 CCL14Q16627 93 aa23.93■■□□□ 1.42
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HOXD12-201ENST00000404162 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 Q3C1V9 767 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 USP6NLQ92738 828 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 HERVK_113P62684 666 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR2Q13614 643 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 WDR18Q9BV38 432 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 BACE1P56817 501 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 JAG1P78504 1218 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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HOXD12-201ENST00000404162 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 EYSQ5T1H1 3165 aa23.89■■□□□ 1.41
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HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GUL7 405 aa23.88■■□□□ 1.41
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HOXD12-201ENST00000404162 PDE3AQ14432 1141 aa23.88■■□□□ 1.41
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HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.88■■□□□ 1.41
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HOXD12-201ENST00000404162 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF521Q96K83 1311 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 SIPA1L1O43166 1804 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 VCANP13611 3396 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 LDHCP07864 332 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 RGS2P41220 211 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-9P63128 1117 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-24P63145 666 aa23.87■■□□□ 1.41
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