RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE6AP16499 860 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PALD1Q9ULE6 856 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL11O14625 94 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 USP5P45974 858 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 HAUS7Q99871 368 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ERO1AQ96HE7 468 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRFP10586 1907 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 SP3Q02447 781 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 MOGSQ13724 837 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH7P12883 1935 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DOAP06340 250 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 CAP2P40123 477 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 PDHXO00330 501 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC18Q9H819 358 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM17Q9Y577 477 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM75PA6NK02 468 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR2O60603 784 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 GPATCH3Q96I76 525 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 ADD2P35612 726 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.519e-8■■■□□ 18
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 CAP1Q01518 475 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 SPP2Q13103 211 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 LCORLQ8N3X6 602 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 EFCC1Q9HA90 598 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L5A8MUK1 530 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC6Q86TZ1 520 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMT1Q9H993 441 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 CPA4Q9UI42 421 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 GDF11O95390 407 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 CHGBP05060 677 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 JAG1P78504 1218 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 EHD4Q9H223 541 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 MBD4O95243 580 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ASNSP08243 561 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2C8P10632 490 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE3CQ15386 1083 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf99Q6UX52 265 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF6Q15052 776 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCD1P51178 756 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF22Q14807 665 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 GINM1Q9NU53 330 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKAB2O43741 272 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms