RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 APPL2Q8NEU8 664 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K14Q99558 947 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-202ENST00000380828 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.162e-7■■■□□ 16.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ZEB2O60315 1214 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A2P04920 1241 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 USP11P51784 963 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 PDXDC1Q6P996 788 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX12PQ92771 950 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 AK9Q5TCS8 1911 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SGSM2O43147 1006 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GPTP24298 496 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 NF2P35240 595 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 RASA2Q15283 850 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 STON2Q8WXE9 905 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 PIF1Q9H611 641 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 MSL3P1P0C860 447 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SPDL1Q96EA4 605 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SLMAPQ14BN4 828 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SAAL1Q96ER3 474 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF1AQ12756 1690 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 PRLRP16471 622 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 POLD2P49005 469 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GFPT2O94808 682 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 BPIFB3P59826 476 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CTAG1AP78358 180 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TCEAL1Q15170 157 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT77Q7Z794 578 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 UBXN4Q92575 508 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CDHR1Q96JP9 859 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOM2P54296 1465 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PQ67 120 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 RASA4O43374 803 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 OPA1O60313 960 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SRGNP10124 158 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G4AP47712 749 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 EMC10Q5UCC4 262 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FNBP1Q96RU3 617 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 DLC1Q96QB1 1528 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1B10O60218 316 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 INPP5BP32019 993 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 BNIP1Q12981 228 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CRY1Q16526 586 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.75□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRCP08575 1304 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM221A6NGB7 291 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SMYD1Q8NB12 490 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 WHAMMQ8TF30 809 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GLULP15104 373 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
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