RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 USP14P54578 494 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 BRF1Q92994 677 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF570Q96NI8 536 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PTPRGP23470 1445 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRD1A4D1F6 860 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PIDD1Q9HB75 910 aa9.56□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MYOM2P54296 1465 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB11FIP3O75154 756 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RASA3Q14644 834 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NCAPHQ15003 741 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 EBF2Q9HAK2 575 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF5BP33176 963 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SCTRP47872 440 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ADCY9O60503 1353 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SHPRHQ149N8 1683 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 JAK2O60674 1132 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SASH1O94885 1247 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 AMPHP49418 695 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 BLMHQ13867 455 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CAGE1Q8TC20 777 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 C2CD2Q9Y426 696 aa9.55□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RASSF10A6NK89 507 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MGRN1O60291 552 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 HSF2BPO75031 334 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NLRP12P59046 1061 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SKOR1P84550 965 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RESTQ13127 1097 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NNTQ13423 1086 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SLMAPQ14BN4 828 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PTGISQ16647 500 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 LAMC1P11047 1609 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PPP1R37O75864 691 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 APBA1Q02410 837 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 TC2NQ8N9U0 490 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 NUP160Q12769 1436 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 DISP1Q96F81 1524 aa9.54□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 DPPA5A6NC42 116 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ALDH1B1P30837 517 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 Q4G0T1 1027 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP10DQ9P241 1426 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PPFIA3O75145 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MYL5Q02045 173 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 TTMPQ5BVD1 217 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ATL3Q6DD88 541 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 C17orf50Q8WW18 174 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 HVCN1Q96D96 273 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 USP28Q96RU2 1077 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms