RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 MED10Q9BTT4 135 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 INF2Q27J81 1249 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC25Q86WR0 208 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TTC14Q96N46 770 aa14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ELP1O95163 1332 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GPAA1O43292 621 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 P4HA1P13674 534 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SMC6Q96SB8 1091 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CALCRLQ16602 461 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ADAMTS12P58397 1594 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ABCC2Q92887 1545 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SPOPO43791 374 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ZBTB16Q05516 673 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 RNF169Q8NCN4 708 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GMNNO75496 209 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ALDH3A1P30838 453 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ASIC2Q16515 512 aa14.51□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TIGD1Q96MW7 591 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 DOK7Q18PE1 504 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SMIM23A6NLE4 172 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 OPA1O60313 960 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PRDM1O75626 825 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CNKSR1Q969H4 720 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 RPS6KB1P23443 525 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 LGR6Q9HBX8 967 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PIK3C2GO75747 1445 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CTSWP56202 376 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.5□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ATP2C2O75185 946 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 DCTPP1Q9H773 170 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GCNT3O95395 438 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SKILP12757 684 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CALCOCO2Q13137 446 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TRIM7Q9C029 511 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SORBS3O60504 671 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 HOXB7P09629 217 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 OSBPP22059 807 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC6Q16204 474 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 UIMC1Q96RL1 719 aa14.49□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 DNAI1Q9UI46 699 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CHMLP26374 656 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CBX1P83916 185 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 DEPTORQ8TB45 409 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TTC38Q5R3I4 469 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 TNNC1P63316 161 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.48□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ATL3Q6DD88 541 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SLC27A2O14975 620 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 CETN3O15182 167 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 ALAS1P13196 640 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 SUCLG2Q96I99 432 aa14.47□□□□□ -0.09
NLRC3-202ENST00000359128 IFT81Q8WYA0 676 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms