RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FSIP1Q8NA03 581 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IQUBQ8NA54 791 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 AIDAQ96BJ3 306 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SCLT1Q96NL6 688 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CABP5Q9NP86 173 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NDE1Q9NXR1 346 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF853P0CG23 659 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAP2K2P36507 400 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP1P43487 201 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TYRO3Q06418 890 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CALCOCO2Q13137 446 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 HAUS1Q96CS2 278 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 KIFC3Q9BVG8 833 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PRG0 241 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC151A5D8V7 595 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PDE4CQ08493 712 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NRBF2Q96F24 287 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DCTPP1Q9H773 170 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GNG11P61952 73 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NEK1Q96PY6 1258 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CNPY3Q9BT09 278 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NAPBQ9H115 298 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 YY1AP1Q9H869 796 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MID2Q9UJV3 735 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 AACSQ86V21 672 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TCP11Q8WWU5 503 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ESR2Q92731 530 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 USP21Q9UK80 565 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 F8W8V4 182 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TERB1Q8NA31 727 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNA2Q15822 529 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 WHAMMQ8TF30 809 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NOX5Q96PH1 765 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 KRT13P13646 458 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 UBA7P41226 1012 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP4BP1P59074 171 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NEK11Q8NG66 645 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GW55 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf229H3BNL8 230 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC10P48553 1259 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CAV1Q03135 178 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PLCB4Q15147 1175 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MYD88Q99836 296 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DUX4Q9UBX2 424 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K5Q99683 1374 aa5.47□□□□□ -1.53
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