RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 OTOFQ9HC10 1997 aa14.69□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 HIP1O00291 1037 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 OPTNQ96CV9 577 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 FSD1Q9BTV5 496 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 BCL11AQ9H165 835 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PICK1Q9NRD5 415 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.68□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MYH1P12882 1939 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MBD4O95243 580 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 NEFLP07196 543 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ASNSP08243 561 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 CETPP11597 493 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SNAPC2Q13487 334 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ELP3Q9H9T3 547 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SWAP70Q9UH65 585 aa14.67□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 INPP5BP32019 993 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 CAP2P40123 477 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 GABPAQ06546 454 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 GRM1Q13255 1194 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SBK1Q52WX2 424 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 LCORLQ8N3X6 602 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 OSBP2Q969R2 916 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PALD1Q9ULE6 856 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 FZD1Q9UP38 647 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 FOXN1O15353 648 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPRAP18433 802 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 IFNL1Q8IU54 200 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 ARMT1Q9H993 441 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNQ1-203ENST00000345015 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 IRF6O14896 467 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 GPAA1O43292 621 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 GJA5P36382 358 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 NT5C2P49902 561 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 C12orf60Q5U649 245 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ZIC5Q96T25 663 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 WDR18Q9BV38 432 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF186Q9NXI6 227 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 DOCK1Q14185 1865 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 USP17L5A8MUK1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 OTUD5Q96G74 571 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC17Q96LX7 622 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 SIPA1L1O43166 1804 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ZMYM6O95789 1325 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ALX1Q15699 326 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJC18Q9H819 358 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 C19orf81C9J6K1 198 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 PLCD1P51178 756 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 CCL15Q16663 113 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 TTC22Q5TAA0 569 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1-203ENST00000345015 TNS4Q8IZW8 715 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms