RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ELF2Q15723 593 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 RTN1Q16799 776 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 ARMT1Q9H993 441 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 INCENPQ9NQS7 918 aa25.91■■□□□ 1.74
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HOXD1-201ENST00000331462 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP100Q494V2 611 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 TMTC2Q8N394 836 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 FANCLQ9NW38 375 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 RTL9Q8NET4 1388 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD18B2RXH4 712 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 DEXIO95424 95 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 GUCY1A2P33402 732 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
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HOXD1-201ENST00000331462 POSTNQ15063 836 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 MLKLQ8NB16 471 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 INTS13Q9NVM9 706 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 KIF20AO95235 890 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF18P17022 549 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 PDE4BQ07343 736 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM139Q8IV31 216 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 DACH1Q9UI36 760 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 LAMB2P55268 1798 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP6O43182 974 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 LCORLQ8N3X6 602 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 TDO2P48775 406 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 MORC3Q14149 939 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 KRT222Q8N1A0 295 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.86■■□□□ 1.73
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HOXD1-201ENST00000331462 TMEM232C9JQI7 657 aa25.85■■□□□ 1.73
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ERICH2A1L162 156 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 FOXN1O15353 648 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN12O43309 604 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 PRKAB2O43741 272 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 HOMER1Q86YM7 354 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA20Q8TB22 786 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 RREB1Q92766 1687 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 GRIN1Q05586 938 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 FANCBQ8NB91 859 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 PHLPP1O60346 1717 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
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HOXD1-201ENST00000331462 SMARCE1Q969G3 411 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 BTG4Q9NY30 223 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 DNAI1Q9UI46 699 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 STX10O60499 249 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 PRR29P0C7W0 189 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 PPARAQ07869 468 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD1-201ENST00000331462 SEC23AQ15436 765 aa25.8■■□□□ 1.72
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