RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315480.8

USP20-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-201ENST00000315480 CCDC42Q96M95 316 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 GPR108Q9NPR9 543 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TXKP42681 527 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TTC38Q5R3I4 469 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KRT83P78385 493 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 GNG11P61952 73 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 FAM182BQ5T319 152 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 GREM2Q9H772 168 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 DNM3Q9UQ16 869 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ABCC4O15439 1325 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TACC1O75410 805 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CIAO1O76071 339 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SCNN1DP51172 638 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KIFC2Q96AC6 838 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ANO1Q5XXA6 986 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PLIN2Q99541 437 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CETN3O15182 167 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 UBE3CQ15386 1083 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 USH1GQ495M9 461 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.62□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 BTDP43251 543 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CCNA1P78396 465 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ICA1Q05084 483 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KIF5AQ12840 1032 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 DPH6Q7L8W6 267 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 AFF2P51816 1311 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 STX10O60499 249 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CPA1P15085 419 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TTC16Q8NEE8 873 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 RPS6KA4O75676 772 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.61□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 GLG1Q92896 1179 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TTLL6Q8N841 843 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PIGBQ92521 554 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 HAUS7Q99871 368 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ATG3Q9NT62 314 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PALLDQ8WX93 1383 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KRT86O43790 486 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CUTAO60888 179 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 NPR1P16066 1061 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 STX17P56962 302 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SNX16P57768 344 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 PDE4DQ08499 809 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TRPC3Q13507 836 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 C8orf34Q49A92 452 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 CEP135Q66GS9 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 MMP10P09238 476 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 LRRC24Q50LG9 513 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KDM6BO15054 1643 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 E7EWF7 191 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ALAS1P13196 640 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ADRA2BP18089 450 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ARID5AQ03989 594 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 IWS1Q96ST2 819 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 ATP2A1O14983 1001 aa14.59□□□□□ -0.07
USP20-201ENST00000315480 TYRO3Q06418 890 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms