RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 BIN1O00499 593 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF11Q86T75 865 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 RAI14Q9P0K7 980 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 NCAPHQ15003 741 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CCZ1BP86790 482 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 ABCF2Q9UG63 623 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-201ENST00000311008 BTBD18B2RXH4 712 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA3EO15041 775 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 NRDCO43847 1150 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SMC2O95347 1197 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 XBP1P17861 261 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 OLFM4Q6UX06 510 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CNNM3Q8NE01 707 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 IFNKQ9P0W0 207 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SYCP1Q15431 976 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CBFA2T2O43439 604 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 PTPREP23469 700 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 GUCY1A2P33402 732 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 MYL5Q02045 173 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SEC23AQ15436 765 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ERFEQ4G0M1 354 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CLIC6Q96NY7 704 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 GYG1P46976 350 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 KCNJ6P48051 423 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ARID5BQ14865 1188 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 TNKSO95271 1327 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CEP135Q66GS9 1140 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN14Q15678 1187 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 LONRF3Q496Y0 759 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CALM1P0DP23 149 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CALM2P0DP24 149 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CALM3P0DP25 149 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 FANCCQ00597 558 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 PNOCQ13519 176 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 FGRP09769 529 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 KANK3Q6NY19 840 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 TMC6Q7Z403 805 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 IQCA1Q86XH1 822 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 NYXQ9GZU5 481 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GUL6 1792 aa22.45■■□□□ 1.19
SPNS1-201ENST00000311008 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 DACH1Q9UI36 760 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA1SQ13698 1873 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.45■■□□□ 1.18
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