RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.55■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 NID2Q14112 1375 aa26.55■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 BTDP43251 543 aa26.54■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.54■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.54■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 LAMB1P07942 1786 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 H0YIN7 160 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ORC4O43929 436 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 RTN1Q16799 776 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 DOK7Q18PE1 504 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 ALG1Q9BT22 464 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP45Q9UL16 551 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf60Q5U649 245 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 IQCA1Q86XH1 822 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 FBXW7Q969H0 707 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA5P30532 468 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.51■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.51■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
VSTM4-201ENST00000298454 PDE4BQ07343 736 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 FANCBQ8NB91 859 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 USP28Q96RU2 1077 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 NMT2O60551 498 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 IFNAR1P17181 557 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 STYK1Q6J9G0 422 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 PGBD1Q96JS3 809 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 RCAN1P53805 252 aa26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CERS5Q8N5B7 392 aa26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO41Q8TF61 875 aa26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 KIF28PB7ZC32 967 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 MXD3Q9BW11 206 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 RBSNQ9H1K0 784 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 GAKO14976 1311 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 STK36Q9NRP7 1315 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 LIG1P18858 919 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 RHBDL3P58872 404 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 SLF2Q8IX21 1173 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 TEX11Q8IYF3 940 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 F8W031 263 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY1A2P33402 732 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 PLCD1P51178 756 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 KRT40Q6A162 431 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF11Q86T75 865 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CERS3Q8IU89 383 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 TSPY2A6NKD2 308 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.47■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 G3V3G9 751 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 ATL3Q6DD88 541 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 EYA3Q99504 573 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 RGS22Q8NE09 1264 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM4-201ENST00000298454 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.45■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.45■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 FLT1P17948 1338 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 PLCG2P16885 1265 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 BAG6P46379 1132 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TROAPQ12815 778 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 SLX4Q8IY92 1834 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TFAP4Q01664 338 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 BRAPQ7Z569 592 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.44■■□□□ 1.82
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