RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.95■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.95■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 GINM1Q9NU53 330 aa22.94■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.94■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 TLR2O60603 784 aa22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PDE6AP16499 860 aa22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 CAP2P40123 477 aa22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.93■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 TTC6Q86TZ1 520 aa22.92■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.92■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PDHXO00330 501 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PALD1Q9ULE6 856 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM17Q9Y577 477 aa22.91■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 FAM196BA6NMK8 535 aa22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 KIF22Q14807 665 aa22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 EFCC1Q9HA90 598 aa22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 OTOFQ9HC10 1997 aa22.89■■□□□ 1.26
MALSU1-201ENST00000287543 USP17L5A8MUK1 530 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 ASNSP08243 561 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 SLURP2P0DP57 97 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 MOGSQ13724 837 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 CRBNQ96SW2 442 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.89■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 EHD4Q9H223 541 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.88■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM75PA6NK02 468 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 GNRH1P01148 92 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 ADD2P35612 726 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 UBE3CQ15386 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.87■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.86■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 C17orf99Q6UX52 265 aa22.86■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.86■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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MALSU1-201ENST00000287543 WDR18Q9BV38 432 aa22.86■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 ERC2O15083 957 aa22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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MALSU1-201ENST00000287543 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 GCC1Q96CN9 775 aa22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 LAMB1P07942 1786 aa22.85■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC18Q9H819 358 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA3Q9UL41 463 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.84■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 RGS19P49795 217 aa22.83■■□□□ 1.25
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MALSU1-201ENST00000287543 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.83■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.83■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.83■■□□□ 1.25
MALSU1-201ENST00000287543 C19orf81C9J6K1 198 aa22.82■■□□□ 1.24
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MALSU1-201ENST00000287543 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.82■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 LCORLQ8N3X6 602 aa22.82■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.82■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 CPA4Q9UI42 421 aa22.82■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 AK9Q5TCS8 1911 aa22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 DOCK2Q92608 1830 aa22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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MALSU1-201ENST00000287543 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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MALSU1-201ENST00000287543 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 ARMT1Q9H993 441 aa22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.81■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 BACE1P56817 501 aa22.8■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MALSU1-201ENST00000287543 CABP5Q9NP86 173 aa22.8■■□□□ 1.24
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