RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278520.9

CCDC82-201, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC82, Length 2,941 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-201ENST00000278520 USP35Q9P2H5 1018 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 GGT7Q9UJ14 662 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CPDO75976 1380 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PEAK1Q9H792 1746 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CPB1P15086 417 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ITGAEP38570 1179 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NEUROD1Q13562 356 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 FAM35AQ86V20 835 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SIN3BO75182 1162 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PBX4Q9BYU1 374 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SBF2Q86WG5 1849 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SLIT2O94813 1529 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NFAT5O94916 1531 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ERBB4Q15303 1308 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PERM1Q5SV97 790 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 USP48Q86UV5 1035 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TNFRSF25Q93038 417 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 C8orf37Q96NL8 207 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NCAPD2Q15021 1401 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 RTL1A6NKG5 1358 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CEP135Q66GS9 1140 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 MDFIQ99750 246 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TINF2Q9BSI4 451 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 MUC3BQ9H195 1237 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 NHSQ6T4R5 1651 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 A0A096LPE4 126 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 A0A1W2PPZ6 126 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 H3BM21 787 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 FAAP100Q0VG06 881 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 GGA1Q9UJY5 639 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 GHRHP01286 108 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CELA3AP09093 270 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ITPKAP23677 461 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ADH6P28332 368 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ADH7P40394 386 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PLD4Q96BZ4 506 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ATRNO75882 1429 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TONSLQ96HA7 1378 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ENC1O14682 589 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 PAGE1O75459 146 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 KRT76Q01546 638 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 MAP3K11Q16584 847 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 CAPN10Q9HC96 672 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 USP19O94966 1318 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-201ENST00000278520 ARAFP10398 606 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 ATF3P18847 181 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF576Q9H609 170 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 MBIPQ9NS73 344 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 DISP2A7MBM2 1401 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 LY75O60449 1722 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-201ENST00000278520 NUDT8Q8WV74 236 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms